反觀我國(guó)稅收核定征收案件的實(shí)踐，對(duì)案件的合法性進(jìn)行的審查居多，特別是程序上、方法上的審查。在46個(gè)案例中核定征收企業(yè)政策，有11個(gè)判決認(rèn)定了稅務(wù)機(jī)關(guān)的具體行政行為有違法之處，且均為主體資格、程序規(guī)范、事實(shí)認(rèn)定等方面的審查。在以上46個(gè)案例中核定征收企業(yè)政策，有關(guān)核定征收方法的爭(zhēng)議共有8件。其中，關(guān)于營(yíng)業(yè)收入、營(yíng)業(yè)成本核算方法的爭(zhēng)議3件；核定房屋面積1件；核定產(chǎn)量的方法1件；方法選擇順位的爭(zhēng)議1件；定期定額征收的方法1件；核定房屋價(jià)格的方法1件。就核定征收程序方面而言核定征收企業(yè)政策，基本上每一份判決書(shū)中，都會(huì)對(duì)核定征收程序的合法性進(jìn)行論述或闡明。其中，以程序爭(zhēng)議為焦點(diǎn)，有充分研宄價(jià)值的案例有6件。其中，未責(zé)令限期改正的案件1件；需不需要聽(tīng)證的爭(zhēng)議4件；相對(duì)人有無(wú)行使異議權(quán)的案件1件。

稅收核定制度缺失程序性規(guī)定。程序正義在現(xiàn)代法律實(shí)踐中發(fā)揮著重要作用，法律活動(dòng)遵循確定的步驟，通過(guò)合法的途徑和公開(kāi)的過(guò)程，維護(hù)法律的公平正義。我國(guó)稅收核定缺失程序要件，具體表現(xiàn)在：核定征收前期的調(diào)查程序缺失，稅務(wù)機(jī)關(guān)選擇核定方法的任意性，核定、認(rèn)定、征收程序三者沒(méi)有區(qū)分開(kāi)來(lái)。我國(guó)《稅收征收管理法》第52條僅僅明確了追征期和補(bǔ)征期，具體核定的認(rèn)定期和征收期卻沒(méi)有做出說(shuō)明。

稅收核定執(zhí)法是稅收核定制度中很重要的內(nèi)容，稅務(wù)機(jī)關(guān)如果執(zhí)法不嚴(yán)，違法不究，甚至以權(quán)謀私、循私舞弊，那么，稅法的權(quán)威性也就蕩然無(wú)存，更談不上依法治稅了。因此，建立健全稅務(wù)機(jī)關(guān)執(zhí)法責(zé)任制度，既可以防范違法行為的發(fā)生，也可以嚴(yán)格追究懲治違法行為。

稅務(wù)機(jī)關(guān)在稅收征管的過(guò)程中，過(guò)分依賴實(shí)質(zhì)課稅，公民的經(jīng)濟(jì)行為很容易被否定，甚至一種合法的沒(méi)有以避稅為目的的交易也會(huì)在稅法方面得不到認(rèn)可，這樣一來(lái)公民必須遵照稅收的標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行經(jīng)濟(jì)交往從而得出一個(gè)所認(rèn)可的結(jié)果，而不是稅收作為經(jīng)濟(jì)交往的伴生結(jié)果。因此實(shí)質(zhì)課稅必然以稅收法定為服從，即使一個(gè)經(jīng)濟(jì)外在形式被否定，從實(shí)質(zhì)進(jìn)行課稅也要滿足內(nèi)在之稅收要件。

核定征收作為一項(xiàng)稅收認(rèn)定行為，核定的客體是稅基，包含收入、成本、費(fèi)用、利潤(rùn)等。然而，我國(guó)法律上并沒(méi)有明確詳細(xì)的規(guī)定核定征收適用的條件和范圍。在實(shí)踐工作中，稅務(wù)機(jī)關(guān)對(duì)法律條文理解的差異性，容易產(chǎn)生執(zhí)法風(fēng)險(xiǎn)，也不可避免的擴(kuò)大了稅務(wù)機(jī)關(guān)的自由裁量權(quán)。準(zhǔn)確界定稅收核定的適用范圍和條件可以有效的遏制稅收的不必要的流失。對(duì)不同類型和行業(yè)應(yīng)該區(qū)別對(duì)待，根據(jù)準(zhǔn)確的納稅信息，對(duì)此制定合理可行的參考標(biāo)準(zhǔn)。

在核定征收舉證過(guò)程中，會(huì)涉及到一個(gè)重要問(wèn)題，這個(gè)問(wèn)題會(huì)影響到對(duì)核定征收的判斷，那就是納稅人提供的證據(jù)材料認(rèn)定的問(wèn)題。在核定征收舉證過(guò)程中，如果這個(gè)問(wèn)題得不到解決核定征收企業(yè)政策，那么納稅人的權(quán)利會(huì)得到很大程度的弱化，因?yàn)榧{稅人提供的證據(jù)是提交給稅務(wù)機(jī)關(guān)的，納稅人提供的證據(jù)的證明力有多大，最終決定權(quán)在稅務(wù)機(jī)關(guān)手里，稅務(wù)機(jī)關(guān)認(rèn)為你是有證明力的就可以不用核定征收，如果認(rèn)為你的證據(jù)不具有證明力，就會(huì)否定你的證據(jù)而不予采納，從而繼續(xù)適用核定征收進(jìn)行征稅。