由于我國(guó)相關(guān)稅法對(duì)企業(yè)所得稅適用核定征收的標(biāo)準(zhǔn)規(guī)定不明確，具體核定方法過于簡(jiǎn)單，導(dǎo)致在實(shí)際工作中稅務(wù)人員對(duì)企業(yè)是否適用企業(yè)所得稅核定方式、核定的應(yīng)納稅所得率以及具體應(yīng)納稅額上，都存在較大的主觀性。過大的自由裁量權(quán)就容易滋生腐敗，具體表現(xiàn)為權(quán)力濫用和權(quán)力尋租。稅務(wù)機(jī)關(guān)認(rèn)定企業(yè)企業(yè)所得稅核定方式的流程操作上，如果權(quán)力沒得到有效監(jiān)管，就有濫用權(quán)力的風(fēng)險(xiǎn)。某些稅務(wù)征收部門由于人手少、業(yè)務(wù)素質(zhì)差，為了方便省事，對(duì)納稅人的管理限于一定了之。

雖然法律規(guī)定，一旦行政權(quán)的行使出現(xiàn)了“濫用職權(quán)”和“顯失公平”的問題，人民法院可以做出變更判決和撤銷判決，以此實(shí)現(xiàn)司法權(quán)對(duì)行政權(quán)的控制。但是，在核定征收方面，人民法院并沒有依據(jù)“濫用職權(quán)”和“顯失公平”進(jìn)行處理的案例。反之，在個(gè)別判決中存在“法院一般應(yīng)尊重稅務(wù)機(jī)關(guān)基于法定調(diào)查程序作出的專業(yè)認(rèn)定，除非這種認(rèn)定明顯不合理或者濫用職權(quán)”的論證，這與“濫用職權(quán)”和“顯失公平”本身含義不清有關(guān)。自《行政訴訟法》頒布以來，至今為止，立法對(duì)“濫用職權(quán)”和“顯失公平”并沒有做出明確的界定，理論界雖一直在探討二者的含義和表現(xiàn)形式，但終究沒能形成一個(gè)相對(duì)統(tǒng)一的認(rèn)識(shí)，致使其無法在核定征收案件的裁判中得到真正應(yīng)用。這為司法控制的實(shí)踐帶來極為不利的影響，使很大部分的合理性審查無法進(jìn)行，削弱了司法監(jiān)督作用的發(fā)揮。

作為一個(gè)拍賣的樓房，是否需要考慮拍賣這一情形，我們知道現(xiàn)實(shí)中物品的拍賣價(jià)與通過其他協(xié)商交易達(dá)成的價(jià)格會(huì)出現(xiàn)很大的差別，這種差別不是人為造成的，而是由市場(chǎng)整體造成的，因?yàn)榇瞬顑r(jià)的原因造成了稅收的不利益不應(yīng)該由物品所有人承擔(dān)，這遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過了物品所有人的責(zé)任范圍。任何人不得證明其無罪，同樣的道理，德發(fā)公司在稅務(wù)糾紛中不得自我證明拍賣的房產(chǎn)計(jì)稅依據(jù)偏低，誠(chéng)然德發(fā)公司有稅務(wù)協(xié)力義務(wù)，但計(jì)稅依據(jù)明顯偏低的責(zé)任是由稅務(wù)機(jī)關(guān)來承擔(dān)的。

而在證明標(biāo)準(zhǔn)方面，我國(guó)臺(tái)灣地區(qū)學(xué)者黃士洲對(duì)此有獨(dú)到的理論研究。在對(duì)課稅要件的法律事實(shí)進(jìn)行舉證時(shí)，稅務(wù)機(jī)關(guān)及納稅義務(wù)人均應(yīng)達(dá)到“一般有理性之人均不至于懷疑之確信程度”，量化來說至少相當(dāng)于60%以上之確信程度。而對(duì)裁罰要件事實(shí)而言，稅務(wù)機(jī)關(guān)則“應(yīng)以更高之蓋然性，即幾近真實(shí)之確信，量化則至少要求80%以上之確信程度”，且受“疑則有利被告”原則之支配公司核定征收。而另一方進(jìn)行反證時(shí)，只需在原來的舉證所達(dá)到的法律要求的證明程度基礎(chǔ)之上，使得審判人員存有疑惑就可，此時(shí)反證即告結(jié)束，需另一方就疑點(diǎn)再次舉證。

《核定征收辦法》中要求納稅人在每年的上半年就確定當(dāng)年是否適用核定征收企業(yè)所得稅的方式，稅務(wù)機(jī)關(guān)則參考上年度企業(yè)的所得稅征收方式來審批當(dāng)年的方式公司核定征收。然而這種模式并不適用于所有納稅人，其中《核定征收辦法》第五條“參照當(dāng)?shù)赝愋袠I(yè)或者類似行業(yè)納稅人的稅負(fù)水平核定?”，針對(duì)一些易遭受經(jīng)濟(jì)影響的行業(yè)，依據(jù)此方法核定企業(yè)所得稅，就會(huì)造成企業(yè)稅負(fù)能力明顯偏差的情況。

稅法學(xué)界倒是做出了一些有益的探討。有學(xué)者認(rèn)為：“稅收核定是指稅務(wù)機(jī)關(guān)依照稅法的規(guī)定，確定稅收債務(wù)關(guān)系的具體內(nèi)容，如納稅數(shù)額、納稅期限、納稅地點(diǎn)等。稅收核定不具有創(chuàng)設(shè)納稅義務(wù)的作用，只是一種確認(rèn)行為，屬于準(zhǔn)法律行為的范圍?！?還有的學(xué)者認(rèn)為，“核定征收是指稅務(wù)人員在不能通過正常的、規(guī)范的查賬手段征收稅款的情況下公司核定征收，憑借可以觀察到的線索，可以搜集到的零星資料、可以參考推測(cè)的基本數(shù)據(jù)等對(duì)應(yīng)納稅額進(jìn)行推定，并根據(jù)推定結(jié)果進(jìn)行征稅的方法公司核定征收?！?/p>